این بخش از سال 1382 تاسیس گردیده که پيشگيری، تشخيص و درمان كليه سنگ های ادراری در اين مركز با آخرين فناوری دانش پزشكی صورت می گيرد.این بخش مجهز به دستگاه سنگ شکن برون اندامی compact-delta بوده که تحت هدایت اشعه X عمل سنگ شکنی انجام می شود. سنگ شکنی در این بخش، تحت نظارت فوق تخصص ارولوژی و توسط تکنسین سنگ شکنی، بدون درد انجام می پذیرد. میزان موفقیت سنگ شکنی در این بخش بسیار عالی و قابل مقایسه با بزرگترین مراکز جهان بوده و بیش از 85 درصد بیماران درمان می شوند.پذیرش بیماران از ساعت 8 صبح تا 8 شب می باشد. در این بخش هدف اصلی، درمان بیمار با رعایت اصول استاندارد و ایجاد رضایت کامل وی میباشد.